Profil lulusan Program Studi S3 Pendidikan Sains Universitas Negeri Surabaya  adalah Pendidik, Inovator, dan Peneliti dalam Pendidikan Sains yang memiliki kualifikasi sebagai berikut:

No	Profil Lulusan	Kualifikasi
1	Pendidik	Pendidik yang mampu memfasilitasi belajar dan meningkatkan kinerja melalui penciptaan, pemanfaatan dan pengelolaan proses pembelajaran sains yang inovatif.
2	Peneliti	Peneliti, yang mampu (1) mengeksplorasi, mengevaluasi, mensintesis, dan menerapkan metode penelitian untuk meningkatkan pembelajaran dan meningkatkan kinerja, (2) mampu melakukan penelitian secara tepat untuk memperoleh kajian secara multidisiplin, interdisiplin, dan transdisiplin, (3) mampu menerapkan dan/atau mengembangkan hasil penelitian untuk kepentingan pembelajaran sains.
3	Inovator	Lulusan memiliki kepekaan terhadap kebutuhan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi dalam bidang pendidikan sains sehingga memiliki kreativitas dan inovasi untuk melakukan perubahan dan memberikan solusi untuk meningkatkan kualitas pendidikan sains